Koronavírus: mutácie

a Christiane Fux, lekárska redaktorka Aktualizované dňa

Maximilian Reindl študoval chémiu a biochémiu na LMU v Mníchove a od decembra 2020 je členom redakčného tímu Oboznámi sa s vami s témami lekárskej, vedeckej a zdravotnej politiky, aby boli zrozumiteľné a zrozumiteľné.

Ďalšie príspevky od Maximiliana Reindla

Christiane Fux študovala žurnalistiku a psychológiu v Hamburgu. Skúsený lekársky redaktor píše od roku 2001 články do časopisov, správy a vecné texty na všetky mysliteľné zdravotné témy. Okrem práce pre je Christiane Fux aktívna aj v próze. Jej prvá kriminálna novela vyšla v roku 2012 a taktiež píše, navrhuje a vydáva vlastné kriminálne hry.

Ďalšie príspevky od Christiane Fux Všetok obsahu kontrolujú lekárski novinári.

V súčasnej dobe je pre expertov obzvlášť zaujímavý delta variant zo Sars-CoV-2: Zdá sa, že je nielen nákazlivejší, ale aj nebezpečnejší ako pôvodný divoký typ. Ostatné mutácie sa ukázali byť prinajmenšom nákazlivé. Tu môžete zistiť, aké vlastnosti majú rôzne mutácie koronavírusu, kde sa šíria a prečo očkovanie stále veľmi dobre chráni.

Mutácie sú normálne

Vznik nových vírusových variantov nie je nič neobvyklé: Vírusy - vrátane patogénu Sars -CoV -2 - počas replikácie opakovane náhodne menia svoj genetický materiál. Väčšina takýchto mutácií nemá zmysel. Niektoré sú však pre vírus prospešné a prevažujú.

Vírusy sa tak dokážu rýchlo prispôsobiť prostrediu a svojmu hostiteľovi. Je to súčasť ich evolučnej stratégie.

Medzitým sa však so Sars-CoV-2 objavili takzvané „Varianty záujmu“ (VoC)-teda varianty, ktoré sa týkajú odborníkov. Spoločné majú to, že sú nákazlivejšie ako pôvodná forma Sars-CoV-2.

Ide o tieto štyri varianty:

• Alpha: Linka, známa tiež ako B.1.1.7, sa šíri z Veľkej Británie.
• Beta: Linka, známa aj ako B.1.351, sa šíri z Južnej Afriky.
• Gama: Linka, známa tiež ako P.1, sa šíri z Brazílie.
• Delta: Linka, známa tiež ako B.1.617, sa šíri z Indie.

Vírusové variácie sú zoskupené do takzvaných kladov alebo línií - vedci vytvárajú akýsi „rodokmeň koronavírusu“. Každý variant je charakterizovaný svojim genetickým zložením a kombináciou písmen a číslic. Či je alebo nie je určitý kmeň vírusu nebezpečnejší, sa z tohto označenia určiť nedá - slúži len na systematické zaznamenávanie a dokumentáciu.

Mimochodom: Svetová zdravotnícka organizácia (WHO) nedávno navrhla zavedenie nových názvov pre najdôležitejšie varianty Sars-CoV-2. Podľa WHO majú byť teraz jednotlivé varianty vírusov pomenované vzostupne podľa gréckej abecedy.

Tento nový, jednoduchší a predovšetkým neutrálny popis má zabrániť tomu, aby sa nové varianty vírusov stotožňovali s miestom ich prvej detekcie. Toto má zabrániť neopodstatneným a vedecky neopodstatneným stigmatám, diskriminácii a predsudkom voči jednotlivým krajinám vo verejnej diskusii.

Pravdepodobne. Štúdia zo Škótska publikovaná v prestížnom časopise The Lancet ukazuje, že riziko hospitalizácie pri infekcii Delta je dvakrát vyššie ako pri pôvodnom variante.

Chránia očkovania pred variantom Delta?

Áno. BioNTech / Pfizer chráni 79 percent pred ochorením proti Delta po druhej očkovacej dávke v porovnaní s 92 percentami proti alfa variantu, ktorý bol pôvodne zistený vo Veľkej Británii. Po očkovaní AstraZenecou je ochrana po druhej očkovacej dávke 60 percent v porovnaní so 73 percentami.

Tieto čísla sa týkajú miernych a stredne závažných symptomatických kurzov. Do akej miery sa očkovanie chráni pred ťažkými chorobami a smrťou, sa neberie do úvahy. Ale práve tu by mohlo byť hodnotenie ochrany výrazne lepšie.

Vírus Delta - imunologické fakty

Delta variant koronavírusu (B.1.617) bol prvýkrát nájdený v Indii. Ukazuje tri čiastkové varianty a kombinuje niekoľko charakteristických zmien. Takýto zväzok bol prvýkrát demonštrovaný vo vírusovom variante.

Na jednej strane sú to zmeny v proteíne spike, ktorý sa považuje za „kľúč“ pre ľudskú bunku. Na druhej strane B.1.617 tiež ukazuje zmeny, ktoré sú diskutované ako (možná) úniková mutácia.

B.1.617 konkrétne kombinuje nasledujúce relevantné mutácie:

Mutácia D614G: Môže spôsobiť, že koronavírus je nákazlivejší. Počiatočné modelovanie naznačuje, že B.1.617 sa prenáša najmenej rovnako ľahko ako veľmi nákazlivý alfa variant (B.1.1.7).

Mutácia T478K: Vedie k výmene nenabitej aminokyseliny treonínu za lyzín v polohe 478, protonizovanej za fyziologických podmienok - a teda pozitívne nabitej. Predpokladá sa, že táto výmena aminokyselín ovplyvňuje interakciu s receptorom ACE2. Odborníci sa domnievajú, že by to mohlo spôsobiť vážnejšie ochorenia Covid-19.

Mutácia P681R: Vedci to spájajú aj s možnou zvýšenou virulenciou.

Mutácia E484K: Bola tiež nájdená vo variante beta (B.1.351) a variante gama (P.1). Existuje podozrenie, že je vírus menej citlivý na neutralizačné protilátky, ktoré už boli vytvorené.

Mutácia L452R: Je tiež diskutovaná ako možná úniková mutácia. Kmene koronavírusu s mutáciou L452R boli v laboratórnych experimentoch čiastočne rezistentné na určité protilátky.

Ďalšie známe varianty vírusov

Okrem toho boli vyvinuté ďalšie varianty vírusu Sars-CoV-2, ktoré sa líšia od divokého typu-odborníci ich však v súčasnosti nepočítajú ako VOC. Tieto vírusové kmene sa nazývajú „zaujímavé varianty“ (VOI) - to znamená varianty osobitného záujmu.

Zatiaľ nie je jasné, aký vplyv môžu mať tieto vznikajúce VOI na pandémiu. Ak by obstáli proti kmeňom vírusov, ktoré už sú v obehu, mohli by byť tiež aktualizované na zodpovedajúce VOC.

Zvlášť zaujímavé varianty

Podľa Európskeho centra pre prevenciu a kontrolu chorôb (ECDC) tieto VOI v súčasnosti zahŕňajú:

• Eta: osvedčené v mnohých krajinách (B.1.525)
• Iota: prvý objav v USA v oblasti New Yorku (B.1.526)
• Kappa: prvý objav v Indii (B.1.617.1)
• Lambda: prvý objav v Peru (asi 37)

Okrem toho podľa ECDC existujú ďalšie VOI, ktoré ešte nie sú popísané podľa novej nomenklatúry WHO:

• B. 1 620 neznámeho pôvodu.
• B. 1 621 prvýkrát objavený v Kolumbii.

Podľa informácií ECDC a WHO varianty, ktoré boli predtým uvedené ako epsilon, zeta a theta, už nie sú súčasťou VOI. Variant B.1.616, ktorý bol prvýkrát zistený vo Francúzsku, tiež dlho koloval bez toho, aby mal nejaký významný vplyv na pandémiu.

Varianty pod dohľadom

Rozšírené zameranie zahŕňa aj takzvané „varianty pod monitorovaním“ (VUM) - spoľahlivé, systematické údaje o nich však stále chýbajú. Väčšinou existujú iba dôkazy o ich holej existencii. Zahŕňajú sporadicky sa vyskytujúce varianty alebo „modifikované“ - alebo lepšie povedané ďalej vyvinuté - potomkovia už známych mutácií.

Podľa ECDC tieto vzácne VUM v súčasnosti zahŕňajú:

• B.1.427 a B.1.429 - WHO ich predtým označovala ako Epsilon, teraz je zaradená do nižšej kategórie, prvýkrát objavená v Kalifornii.
• P.2 - WHO predtým označovaná ako Zeta, teraz je zaradená do nižšej kategórie, prvýkrát objavená v Brazílii.
• P.3 - WHO predtým označovaná ako theta, teraz je zaradená do nižšej kategórie, prvýkrát objavená na Filipínach.
• B.1.214.2, A.27, A.28, C.16 a B.1.1.318 - varianty neznámeho pôvodu.
• Ďalšie varianty, ktoré boli prvýkrát zistené v Južnej Afrike: B.1.351 + E516Q a B.1.351 + P384L, C.1.2
• Ďalšie varianty, ktoré boli prvýkrát zistené vo Veľkej Británii: B.1.1.7 + L452R a B.1.1.7 + S494P, A.23.1 + E484K, AV.1, B.1.671.2 + K417N
• Ďalšie varianty, ktoré boli prvýkrát zistené v USA: B.1.526.1, B.1.526.2
• Variant, ktorý bol prvýkrát zistený v Rusku: AT.1
• Varianta, ktorá bola prvýkrát zistená v Egypte: C.36 + L452R
• Varianta, ktorá bola prvýkrát zistená v Mexiku: B.1.1.519

Aj keď je v súčasnosti známy veľký počet nových variantov vírusov, neznamená to automaticky väčšiu hrozbu. Posúdenie rizika v tejto chvíli ešte nie je možné. Nie je možné predvídať ani vplyv tohto VUM na (globálny) infekčný proces. Či sú teda niektoré varianty vírusov relevantné alebo nebezpečné, môže objasniť iba ďalšie pozorovanie.

Ako nebezpečné sú mutácie koronavírusu?

Mutácie koronavírusu oficiálne klasifikované ako „znepokojujúce varianty“ sú podľa súčasného stavu znalostí nebezpečnejšie ako divoký typ koronavírusu. Sú vysoko nákazlivé a ich privlastnené zmeny (únikové mutácie) by mohli podporovať sekundárne infekcie.

Všeobecné hodnotenie, či sú iné mutácie koronavírusu nebezpečnejšie ako pôvodný patogén Sars-CoV-2, však nie je ľahké. Najmä pri novo vznikajúcich variantoch chýbajú skúsenosti a solídna databáza.

Čo znamená vyššia nákazlivá sila?

Ak sa Sars-CoV-2 stane nákazlivejším, bude tiež ťažšie zastaviť jeho šírenie. Opatrenia, ktoré doteraz úspešne obsahovali šírenie, potom už nemusia postačovať.

Ak sa napríklad replikačná hodnota R pre divokú formu vírusu zníži na 0,8 a počet infikovaných ľudí sa postupne zníži, vírus, ktorý je o 35 percent viac nákazlivý, by sa ďalej šíril a uviedol do pohybu reťazce infekcií, ak boli prijaté rovnaké opatrenia.

Čo to znamená pre vakcíny?

Na to neexistuje všeobecná odpoveď. V odborných kruhoch sa živo diskutuje o možnom zníženom ochrannom účinku novo vyvinutých vakcín. Výrobcovia očkovacích látok a predbežné vyšetrovania v tejto súvislosti zatiaľ dali úplne jasno.

Comirnaty napríklad ukazuje v počiatočných štúdiách porovnateľnú účinnosť proti alfa variantu (B.1.1.7) a beta variantu (B.1.351). Zdá sa, že VaxZevria tiež poskytuje dobrú ochranu v B.1.1.7, ale účinnosť voči línii B.1.351 by mohla byť znížená.

Do akej miery budú ostatné očkovacie látky od Moderny a Johnson & Johnson obstáť proti modifikovaným variantom vírusu, nebolo zatiaľ definitívne objasnené.

Ako vírus postupuje, môžu byť potrebné úpravy očkovacej látky. Vzhľadom na pokrok vo vývoji vakcín sa to však dá urobiť v krátkom časovom období. Všetky očkovacie látky schválené v Európskej únii však stále poskytujú účinnú a primeranú ochranu - najmä pred ťažkými a smrteľnými priebehmi ochorenia Covid -19.

Ďalšie informácie o téme vakcín proti koronavírusu nájdete tu.

Ako rýchlo mutuje Sars-CoV-2?

V budúcnosti sa Sars-CoV-2 bude naďalej prispôsobovať ľudskému imunitnému systému a (čiastočne) očkovanej populácii prostredníctvom mutácií. Ako rýchlo sa to stane, závisí vo veľkej miere od veľkosti aktívne infikovanej populácie.

Čím viac prípadov infekcie - regionálnych, národných a medzinárodných - čím viac sa koronavírus množí - tým častejšie dochádza k mutáciám.

V porovnaní s inými vírusmi však koronavírus mutuje relatívne pomaly. S celkovou dĺžkou genómu Sars-CoV-2 asi 30 000 párov báz experti predpokladajú jednu až dve mutácie za mesiac. Na porovnanie: Vírusy chrípky mutujú v rovnakom období dvakrát až štyrikrát častejšie.

Ako sa môžem chrániť pred mutáciami koronavírusu?

Nemôžete sa konkrétne chrániť pred jednotlivými mutáciami koronavírusu - jedinou možnosťou je nenakaziť sa.

Spravidla dodržiavajte hygienické pravidlá, držte si odstup a noste masku FFP2 na verejnosti. Ak sa necháte očkovať, budete sa tešiť aj dobrej základnej imunite proti ťažkým kurzom.

Ako sú objavené mutácie koronavírusu?

Nemecko má úzko prepojený systém hlásení na monitorovanie cirkulujúcich vírusov Sars-CoV-2-nazýva sa to „integrovaný systém molekulárneho sledovania“. Za týmto účelom úzko spolupracujú príslušné zdravotnícke orgány, Inštitút Roberta Kocha (RKI), špecializované diagnostické laboratóriá a konzultačné laboratórium pre koronavírusy v Berlíne.

Ako funguje systém podávania správ v prípade podozrenia na mutáciu?

V prvom rade je potrebné, aby bol každý profesionálne vykonaný pozitívny test na koronavírus hlásený príslušnému zdravotnému orgánu.Patria sem testy na koronavírus, ktoré boli vykonané v testovacom centre, u vášho lekára, vo vašej lekárni alebo vo vládnych zariadeniach - napríklad v školách. Súkromné ​​autotesty sú z toho však vylúčené.

Ďalšie informácie o rýchlych testoch koronavírusu na osobné použitie nájdete v našej téme špeciálne Corona autotesty.

Ak je výsledok pozitívny, lekári odošlú zodpovedajúcu vzorku pacienta do špecializovaného diagnostického laboratória, ktoré výsledok potvrdí pomocou testu PCR. Ak je test PCR tiež pozitívny - vzorku je možné tiež odoslať do sekvenčného laboratória, kde sa dá ďalej preskúmať (analýza sekvenčného genómu).

RKI potom pseudonymizovaným spôsobom porovnáva vykazované údaje a výsledok sekvenčnej analýzy. Pseudonymizované znamená, že nie je možné vyvodiť žiadne závery o jednej osobe. Tieto informácie však predstavujú základňu údajov pre vedcov a zainteresované strany v systéme zdravotnej starostlivosti s cieľom získať presný prehľad o súčasnej situácii pandémie. To umožňuje najlepšie možné vyhodnotenie situácie s cieľom (v prípade potreby) odvodiť politické opatrenia.

Čo je sekvenčná genómová analýza?

Sekvenčná genómová analýza je podrobná genetická analýza. Skúma presnú sekvenciu jednotlivých zložiek RNA vo vírusovom genóme. To znamená, že genóm Sars-CoV-2 obsahujúci približne 30 000 párov báz je dešifrovaný a potom môže byť porovnaný s genómom divokého typu koronavírusu.

Iba týmto spôsobom je možné rozpoznať jednotlivé mutácie na molekulárnej úrovni - a je možné priradenie v rámci „rodokmeňa koronavírusu“.

Sekvenovanie genómu je časovo náročný a nákladný proces s (veľmi) obmedzenými kapacitami. Nie každú pozitívnu vzorku je teda možné rutinne sekvenovať. Odborníci urobia predvoľbu - tak odoberú vzorku.

Z toho je tiež zrejmé, že nie každá krajina na svete je schopná podrobne sledovať presné šírenie určitých variantov koronavírusu. Je preto pravdepodobné, že v dostupných údajoch z vykazovania existuje určitá nejasnosť.

Tagy:  nemocnica športová kondícia túžba mať deti